MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pCC5.2_M

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020290	A	6	6	405	410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020290	TCT	2	6	539	544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020290	TA	3	6	553	558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020290	TTG	2	6	562	567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020290	AAT	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020290	TA	3	6	665	670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020290	A	6	6	1087	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020290	GCAA	2	8	1128	1135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020290	A	6	6	1134	1139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020290	TCG	3	9	1176	1184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020290	TAA	2	6	1198	1203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020290	TAT	2	6	1264	1269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020290	ATTTA	2	10	1313	1322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020290	CAA	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020290	A	8	8	1406	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020290	AGG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020290	TGC	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020290	A	6	6	1446	1451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020290	AAG	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020290	A	6	6	1474	1479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020290	CAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020290	AAAAG	2	10	1563	1572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020290	ATG	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020290	ATT	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.